祭祀是碉楼的一项重要功能。在人们看来，碉楼是家庭最重要的保护神。碉楼楼顶专司祭祀。
东南西北四个角分别代表了平安、健康、驱邪和五畜兴旺。上面放置的白色石头代表供奉的神明。每到逢年过节，要在不同的角落插上不同意义的彩色经幡，当风吹过一遍，祈祷平安吉祥的经文就被风念诵一遍。
大小金川战役之后，尝尽了碉楼苦头的乾隆皇帝命令嘉绒人不允许再建筑碉楼，但是碉楼祭祀功能还是被保留了下来。如今很多嘉绒民居楼顶都会翘起五个角，这便是碉楼祭祀遗风。正中间用来煨桑，四个角楼的意义依然不变，而现代人多数只在春节十分才会再楼房的四个角楼上插起彩色的经幡。
