南莫且湿地自然保护区于2005年3月由省人民政府批准为省级自然保护区以来，壤塘县突出生态建设县为目标，坚持生态保护优先的原则，认真采取强有力措施，推进保护和管理各项工作，取得明显成效。
截至目前，该保护区已经完成填沟还湿20.2km，还湿面积2000hm2；对鼠虫害危害较重的1200hm2地块进行了生物和物理防治。
通过恢复治理，确保了南莫且保护区物种更加丰富、稀有物种多样。区内现有高等植物722种，野生脊椎动物218种；有国家Ⅱ级重点保护野生植物红花绿绒蒿、山莨菪等2种，国家Ⅰ级重点保护野生动物黑颈鹤、白唇鹿、林麝等9种，国家Ⅱ级重点保护野生动物川陕哲罗鲑、豺、黑熊等30种，四川省重点保护野生动物伶鼬、香鼬、艾鼬等8种。
