藏医药学历史悠久 , 源远流长。她的形成和发展大体经过萌芽、奠基、发展、争鸣、繁荣、振兴等六个时期。 

   萌芽时期 ( 远古到公元 6 世纪 ) 这一时期是原始藏药和医疗经验积累阶段。青藏高原是藏医药学的发祥地 , 大约在4000万年前这里还是一片汪洋大海 , 以后地壳上升 , 海水退去 , 现出陆地。约在1200万年时 , 由于造山运动 , 地势隆凸形成高原。藏族史书中也记载说 :“……到处水满成大海 , 地壳隆起水退尽 , 卫康地貌始显露。” 又 说 :“上部阿里三围似湖泊 , 中部卫藏四若象沟渠 , 下部多康六岗如井田。阿里三围鹿马栖息区 , 卫藏四若虎豹出没地 , 下部六岗飞禽嬉戏洲。” 以后这里逐渐成为雪山环绕、湖河纵横 , 草木丰茂 , 动物繁衍 , 矿藏丰富的清凉世界。天地造化的自然环境为藏医藏药的产生创造了优越条件 ,“有了人类 , 就有了医学” , 这一医学起源的论断同样适用于藏医学。据考古学家从西藏地区陆续发现的旧石器、新石器和金石并用的文化遗址证实 , 藏族的祖先很早以前就在青藏高原生活 , 他们在同自然和疾病斗争的漫长过程中 , 逐步积累了丰富的医药知识 , 进而创造了藏医药学。《藏医史》中记载消化不良是藏民族最初认识的 一种疾病。我们知道藏族先民一开始就过着狩猎和逐草而牧的游牧生活 , 由于地处高寒、食用生冷肉乳食品 , 患不消化病自然很普遍 , 火的应用 , 大大改善了他们的生活条件。火可以烧开水 , 煮食物 , 有利于消化 , 火可以取暖 , 防止了许多疾病发生。火还可以直接用于治病 , 《藏医史》记载 , 火燃柏枝、艾叶烟熏住地和衣物可以驱除病邪。 火烧石头热敷、热敷患处用以消肿止痛 , 并由此逐渐产生火灸疗法。另外 , 用新剥动物热皮热敷或用新杀动物胃中糜物热敷 , 治疗腹痛和肿胀、关节炎等疾病。不仅如此 , 早在远古时期 , 藏族先民在生活实践中积累大量防治疾病的知识。

   《宇妥·元丹贡布传》记载 , 远古时藏地 , 人生病怕传染给他人 , 背到离家较远的地方隔离起来 , 医生是父母 , 用调节饮食来治病。以后 , 在石器时代 , 用打制的尖石块割破肿胀放出脓血来治疗肌肤服肿 , 并由此逐步产生了放血疗法和金针疗法。用冷水喷激或用冰冷物体罨敷来治疗炎肿 , 由此总结出冷敷疗法。随着农牧业生产水平的提高 , 掌握了打酥油、酿酒等技术后 , 懂得用 熔酥油止血疗伤 , 酒糟热敷用以消肿等许多原始疗法。 同时 , 从一些动物受伤后 , 本能地寻找一些药物舔食或蹭擦伤口 , 伤口或骨折得以愈合的启示 , 找到许多动物 “断续药” 来治病。这样 , 长期与疾病作斗争的实践中 , 逐渐懂得了许多植、矿、动物有治疗疾病作用的道理。公元前 200年左右 , 对药和毒有了进一步认识 , 据《五部遗教·大臣篇》记载 , 聂赤赞布在雅隆被众部落推举为第一代吐蕃王时 , 他提出六点疑虑 , 其中第五点疑虑是 “有毒何以 治?” 有位智者马上回答说 :“有毒就有药”, 表明当时已经掌握了治疗中毒症的药物。公元 3 世纪 , 第二十七代吐蕃王托托日年赞时期 , 西藏已经出现了专门从事医事活动的医生 , 并在这一时期 , 天竺医生也开始来西藏行医。 《宇妥·元丹贡布传》记载 , 天竺著名医生布吉嘎西和布拉嘎则俩兄妹来藏治好了很多病人。藏王闻听后立即邀请到雍布拉岗宫 , 赐坐于高座 , 热情款待 , 并将公主意吉若恰嫁给其兄 , 期望生子继承医术。后来生下一子取名东格托觉尖 , 长大后两位医生授以《脉诊经》、《饮食疗法经》、《方剂经》等 5 部医书和许多治疗经验返回本国。东格托觉尖继承父业 , 不断钻研 , 终成一代名医 , 曾担任藏 王保健医 , 其子孙几十代皆为名医 , 藏医史中称宇妥世家。据此 , 有人认为藏医源于天竺 , 这是片面的。苏喀派 名医洛哲杰布在《一切知识之源》中说到 :“藏医始于拉托托日年赞时的说法并不可信 , 之前很早就有一种叫本医的医学。” 本教是西藏的一种原始宗教 , 创始人辛绕弥沃齐的长子杰普赤西是一位有成就的医生 , 一生收集有二 万多条医疗经验 , 招收许多弟子讲授《十万疾病·黑函》、 《十万疗法·花函》、《十万药物·自函》等本教医书 , 著有 《治毒·万字符》等医书 , 详细论述了解毒药物——动物宝的来源、分类及其功能。可惜这些医书已经遗供不传 , 但在流传至今的藏医经典著作《四部医典》中还保留着诸如 “达亚干”、“列哲” 、 “达周”  、“曼恰拉” 、 “哲散” 等很多香雄医学 ( 即本医 ) 的术语和药名。扎塘版《四部医典》后记中 也明确注有审订时特别参考了香雄医书《法轮王·医药荟萃》等字样。敦煌石窟中发现的《灸法残卷》中也有许多香雄语的药名和病名。这些资料表明早在公元前500 年前后 , 西藏已有了自己的原始医学。尽管那时的本医巫术和医术混为一体 , 治病过程中充斥着卜病召福 , 祈神乞药等迷信活动 , 但不乏大量原始的医药知识和治疗经验 , 十分珍贵。总之 , 在公元前几世纪 , 藏族先民在漫长的历史过程中 , 与疾病斗争的实践中 , 逐渐积累医药知识和经验 , 具有高原特色的本民族医学开始萌芽。