丹增彭措下功夫对青海东部和南部、西藏东部、四川西部进行实施地调查，后返回维西又是继续进行调查，并对历代藏医药学的经典著作进行深入考证，然后潜心著书立说，前后用了近20年时间，于清道光十五年（1840）写成藏族医药学名著《晶珠本草》，历经5年刊刻，成书问世。《晶珠本草》又名《药物学广论》或《无垢晶串》，藏名《知麦协称》或《协称》，收录藏药2294种，是一部集藏族药物学之大成的巨著。