供奉“玄密神物”
在许多藏文文献中，提出在拉托托日年赞的在位时期，吐蕃已有了佛教，但是对此也有各种不同的说法。在《西藏王统记》和不少教法史中说，拉托托日年赞是普贤菩萨的化身，有一天，当他登上雍布拉康宫顶的时候，从天空降下了《宝箧经》《诸佛菩萨名称经》《百拜忏悔经》，以及一尊一肘高的金塔、旃陀嘛呢印模、木扎手印等物品，并有声音从空中传来：“五代以后，将会出现懂得它们的意义的人。”托托日年赞虽然不认识这些物品，但觉得它们极为珍贵，所以取名为“年波桑哇”（གཉན་པོ་གསང་བ། 即“玄密神物”之意），把它们放置在王宫殿堂，加以供奉，并因此以６０高龄（或说８０）而返老还童，白发转黑、面无皱纹，共享年120岁。在《青史》中指出，班智达聂巴（ནེལ་པ）说，因为苯教崇拜上天，所以就称这些神物从天而降，实际上这些经书和宝物是班智达洛森措（བློ་སེམས་འཚོ）和译师黎提斯（ལི་ཐི་སེ）从印度带来的，但是因为藏王不懂它们的文字之意，所以两人就把它们留了下来，返回了印度。该书的作者认为这种说法才是正确的。
古印度医学的传入
拉托托日年赞时期，印度医学大师碧琪嘎和碧嘎拉孜来到藏地，为藏人治病，并传播医学理论，使当时的医学获得了很大发展。拉托托日年赞把自己的女儿意吉锐恰嫁给印度医学家碧棋嘎为妻，他们生了一个儿子叫童给妥觉间，经由双亲和印度医学家碧嘎拉孜毫无保留的传授，童给妥觉间成了名医，并获得拉托托日年赞的赏识，担任了他后半生的御医。
