1158年他又来到今西藏桑日县境帕木主巴地方建一小寺,创立了帕主噶举。人们称他为帕木主巴,简称帕主。该寺后来扩建成帕主噶举的母寺——邓沙替寺。 帕木主巴后来成为地名、人名、教派支系名、以后出现的家族名和地方政权名五位一体的名字。
帕主多吉甲布到印度留过学,著有《摄布密续》等50余卷论著,其中《帕主道情歌》最著名。
他有800多位弟子,其中有 “四大第一”弟子、“四大教授弟子”、“四大心传”弟子等。他的弟子中达龙唐巴、止贡仁青贝、林惹白玛多吉等分别在康区和卫藏各地建寺招徒、传授教法,自成体系,形成了噶举派8个小支派,其中达龙噶举和止贡嘎举一直延续到1959年以后。